doc. Mgr. David Bednář, Ph.D.
Molekulové modelování a bioinformatika
| e‑mail: |
|---|
David Bednář vede skupinu zaměřenou na molekulové modelování a bioinformatiku v rámci Loschmidtových laboratoří na přírodovědecké fakultě Masarykovy univerzity. Doktorský titul získal v roce 2017 na téže univerzitě v oboru Molekulární a buněčná biologie. Svoji expertízu rozšířil během zahraničních stážích na Rutgers University (USA), University of North Carolina (USA) a Adam Mickiewicz University (Polsko). Na Masarykově univerzitě vyučuje kurz Strukturní biologie a přispívá i do kurzů Proteinové inženýrství a Metody biofyzikální chemie.
David je spoluatorem 33 publikací v impaktovaných vědeckých časopisech (h-index 11), kapitoly v knize a mezinárodního patentu. Podílel se na vývoji 9 bioinformatických nástrojů pro analýzu enzymů a proteinové inženýrství a jedné bioinformatické databáze. Ve své práci využívá in silico přístupy pro vysvětlování enzymologických principů a návrh mutací pro zlepšování vlastností proteinů. V posledních letech se věnuje také medicínským projektům zabývajících se studiem a léčbou Alzheimerovy choroby, mozkové mrtvice nebo rakoviny. Znalosti z enzymologických i medicínských projektů jsou pak dále využity pro vývoj zmíněných bioinformatických nástrojů, které tyto analýzy přibližují širší veřejnosti.
Molekulové modelování a bioinformatika
| e‑mail: |
|---|
Dlouhodobě mimo výkon práce
Nature Communications, rok: 2023, ročník: 14, vydání: 1, DOI
Bioinformatics, rok: 2023, ročník: 39, vydání: 8, DOI
IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics, rok: 2023, ročník: 29, vydání: 1, DOI
Vydavatel: Canadian Intellectual Property Office, stát vydání: Kanada, číslo patentu: CA3006388, rok: 2023
Vydavatel: United States Patent and Trademark Office, stát vydání: Spojené státy americké, číslo patentu: US11746135B2, rok: 2023
Vydavatel: Intellectual Property India, stát vydání: Indie, číslo patentu: IN485239, rok: 2023
ACS Catalysis, rok: 2022, ročník: 12, vydání: 11, DOI
Chem Catalysis, rok: 2022, ročník: 2, vydání: 10, DOI
Rok: 2022
Computational and Structural Biotechnology Journal, rok: 2022, ročník: 20, vydání: May 2022, DOI
| Řešitel na MU: | prof. Ing. Vladimír Šindelář, Ph.D. |
|---|---|
| Fakulta / Pracoviště MU: | Přírodovědecká fakulta |
| Období řešení: |
1/2016 — 12/2016
|
| Investor/Program: |
Masarykova univerzita
/
Grantová agentura MU
|
| Řešitel na MU: | prof. Ing. Vladimír Šindelář, Ph.D. |
|---|---|
| Fakulta / Pracoviště MU: | Přírodovědecká fakulta |
| Období řešení: |
1/2015 — 12/2015
|
| Investor/Program: |
Masarykova univerzita
/
Grantová agentura MU
|
| Řešitel na MU: | prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr. |
|---|---|
| Fakulta / Pracoviště MU: | Přírodovědecká fakulta |
| Období řešení: |
1/2014 — 12/2014
|
| Investor/Program: |
Masarykova univerzita
/
Grantová agentura MU
|
| Řešitel na MU: | prof. RNDr. Jiří Doškař, CSc. |
|---|---|
| Fakulta / Pracoviště MU: | Přírodovědecká fakulta |
| Období řešení: |
1/2010 — 12/2012
|
| Investor/Program: |
Masarykova univerzita
/
Grantová agentura MU
|