Dr. Eva Budinská
Integrativní bioinformatika a biostatistika
Dr. Eva Budinská je vedoucí skupiny Integrativní bioinformatika a biostatistika. Je bioinformatička a biostatistička s hlavním zaměřením na analýzu multimodálnych dát z omicsových experimentů (NGS, hmotnosní spektrometrie, mikročipy...). Její výzkum se zaměřuje zejména na vývoj metod a SW pro analýzu a integraci omicsových dat (genomika, transkriptomika, proteomika, metabolomika metagenomika, ...) a jejich aplikaci na detekci biomarkerů a generování hypotéz zejména v onkologii a exposomovýc studiích (např. Analýza metabolomových a mikrobiomových profilů dětí a matek ze studie CELSPAC, nebo analýza multimodálních profilů kolorektálního karcinomu).
Celkem publikovala 72 vědeckých článků s více než 1970 citacemi (h-index 19), aktuální informace lze najít na webu ResearcherID.
Dr. Budinská se účastní několika Evropských projektů (FP7 a H2020) a dvou národních prijektů (AZV a GAČR) jako PI.
Je vedoucí bakalářských, magisterských a doktorských prací a učí čtyři předměty: Analýza dat v R, Analýza sekvenačních dat, Analýza genomických a protoemických dat, Detekce biomarkerů z omicsových experimentů.

Vedoucí pracoviště
Docenti
Odborní asistenti
Vědeckovýzkumní pracovníci
Odborní pracovníci
Externí pracovníci
Publikace
-
Derivation and Molecular Characterization of a Morphological Subpopulation of Human iPSC Astrocytes Reveal a Potential Role in Schizophrenia and Clozapine Response
SCHIZOPHRENIA BULLETIN, rok: 2022, ročník: 48, vydání: 1, DOI
-
Vegan Diet Is Associated With Favorable Effects on the Metabolic Performance of Intestinal Microbiota: A Cross-Sectional Multi-Omics Study
Frontiers in Nutrition, rok: 2022, ročník: 8, vydání: January, DOI
-
Colorectal Tumour Mucosa Microbiome Is Enriched in Oral Pathogens and Defines Three Subtypes That Correlate with Markers of Tumour Progression
Cancers, rok: 2021, ročník: 13, vydání: 19, DOI
-
Heterogenous mutation spectrum and deregulated cellular pathways in aberrant plasma cells underline molecular pathology of light-chain amyloidosis
haematologica, rok: 2021, ročník: 106, vydání: 2, DOI
-
Microbiome analysis and predicted relative metabolomic turnover suggest bacterial heme and selenium metabolism are altered in the gastrointestinal system of zebrafish (Danio rerio) exposed to the organochlorine dieldrin
Environmental Pollution, rok: 2021, ročník: 268, vydání: January 2021, DOI
Projekty
-
Gut OncoMicrobiome Signatures (GOMS) associated with cancer incidence, prognosis and prediction of treatment response (825410)
Řešitel na MU: Mgr. Eva Budinská, Ph.D. Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta Období řešení: 1/2019 — 6/2024Investor/Program: Evropská unie / Horizon 2020 -
CETOCOEN Plus (CZ.02.1.01/0.0/0.0/15_003/0000469)
Řešitel na MU: prof. RNDr. Jana Klánová, Ph.D. Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta Období řešení: 11/2015 — 6/2023Investor/Program: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR / OP Výzkum, vývoj a vzdělávání (OP VVV) -
Výzkum studentů se zaměřením na chemické látky v prostředí a v lidském těle; transformační mechanismy a jejich působení, vývoj nových molekul umožňujících detekovat a kontrolovat chování a transport vybraných látek, vývoj signálních molekul a senzorů (MUNI/A/1366/2021)
Řešitel na MU: Mgr. Peter Šebej, Ph.D. Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta Období řešení: 1/2022 — 12/2022Investor/Program: Masarykova univerzita / Specifický výzkum - podpora studentských projektů -
Molecular portraits of major morphological components of colon tumors (GA19-08646S)
Řešitel na MU: doc. Ing. Vlad Popovici, PhD Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta Období řešení: 1/2019 — 6/2022Investor/Program: Grantová agentura ČR / Standardní projekty -
Výzkum studentů se zaměřením na chemické látky v prostředí a v lidském těle, na jejich chování, transformační mechanismy a jejich působení, vč. změn, vývoj nových molekul umožňujících detekovat a kontrolovat chování a transport vybraných látek (MUNI/A/1182/2020)
Řešitel na MU: Mgr. Peter Šebej, Ph.D. Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta Období řešení: 1/2021 — 12/2021Investor/Program: Masarykova univerzita / Specifický výzkum - podpora studentských projektů
Další informace
Vedené práce
Obor: Bio-omika
Témata závěrečných prací (konzultant)
- The non-coding and coding RNA networks in the biology of B-cell leukemias and lymphomas – absolvent 2021
Obor: Environmentální chemie a toxikologie
Témata závěrečných prací (školitel)
- Mikrobiom u pacientů s kolorektálním karcinomem a u zdravých osob – probíhající studium
Témata závěrečných prací (konzultant)
- Studium prevalence genů pro antibiotickou rezistenci – probíhající studium
Výuka
Vyučované předměty
Akademický rok 2021–2022
Jaro 2022 na Lékařské fakultě
Podzim 2021 na Lékařské fakultě
Jaro 2022 na Přírodovědecké fakultě
- Analýza genomických a proteomických dat
- Analýza necílených dat z MS
- Bakalářská práce z matematické biologie a biomedicíny II
- Bakalářská práce z matematické biologie II
- Diplomová práce II
- Diplomová práce IV
- RNAseq analýza
- Týmový projekt z Matematické biologie a biomedicíny – biomedicínská bioinformatika
- Úvod do matematické biologie a biomedicíny II
Podzim 2021 na Přírodovědecké fakultě
- Analysis of sequencing data
- Analýza dat v R
- Analýza sekvencí DNA
- Bakalářská práce z matematické biologie a biomedicíny I
- Bakalářská práce z matematické biologie a biomedicíny II
- Detekce biomarkerů z omics experimentů
- Diplomová práce I
- Diplomová práce II
- Diplomová práce III (Bi9006, Bi9013)
- Diplomová práce IV.
- Experimentální onkologie
- Projekt z Matematické biologie a biomedicíny - biomedicínská bioinformatika
- Úvod do matematické biologie a biomedicíny I
- Vícerozměrné metody - cvičení