Dr. Eva Budinská
Integrativní bioinformatika a biostatistika
Dr. Eva Budinská je vedoucí skupiny Integrativní bioinformatika a biostatistika. Je bioinformatička a biostatistička s hlavním zaměřením na analýzu multimodálnych dát z omicsových experimentů (NGS, hmotnosní spektrometrie, mikročipy...). Její výzkum se zaměřuje zejména na vývoj metod a SW pro analýzu a integraci omicsových dat (genomika, transkriptomika, proteomika, metabolomika metagenomika, ...) a jejich aplikaci na detekci biomarkerů a generování hypotéz zejména v onkologii a exposomovýc studiích (např. Analýza metabolomových a mikrobiomových profilů dětí a matek ze studie CELSPAC, nebo analýza multimodálních profilů kolorektálního karcinomu).
Celkem publikovala 72 vědeckých článků s více než 1970 citacemi (h-index 19), aktuální informace lze najít na webu ResearcherID.
Dr. Budinská se účastní několika Evropských projektů (FP7 a H2020) a dvou národních prijektů (AZV a GAČR) jako PI.
Je vedoucí bakalářských, magisterských a doktorských prací a učí čtyři předměty: Analýza dat v R, Analýza sekvenačních dat, Analýza genomických a protoemických dat, Detekce biomarkerů z omicsových experimentů.

Vedoucí pracoviště
Docenti
Odborní asistenti
Odborní pracovníci
Publikace
-
Cílená detekce somatických mutací u pacientů s ameloblastomem: série případů
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
Orální bakteriom u pacientů s dlaždicobuněčným karcinomem dle stavu jejich dentice: pilotní studie
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
Derivation and Molecular Characterization of a Morphological Subpopulation of Human iPSC Astrocytes Reveal a Potential Role in Schizophrenia and Clozapine Response
SCHIZOPHRENIA BULLETIN, rok: 2022, ročník: 48, vydání: 1, DOI
-
Effect of mode of delivery and intrapartum antibiotic prophylaxis on gut bacteriome of newborns in the first days of their life: a case-control study
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
-
Helicobacter analysis in gastric mucosa samples – comparison of two methodical approaches
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
Projekty
-
Discovering the causes of three poorly understood cancers in Europe (101096888)
Řešitel na MU: prof. RNDr. Jana Klánová, Ph.D. Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta Období řešení: 1/2023 — 12/2027Investor/Program: Evropská unie / Horizont Evropa -
A European-wide foundation to accelerate Data-driven Cancer Research (101058427)
Řešitel na MU: prof. RNDr. Jana Klánová, Ph.D. Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta Období řešení: 9/2022 — 2/2025Investor/Program: Evropská unie / Horizont Evropa -
Gut OncoMicrobiome Signatures (GOMS) associated with cancer incidence, prognosis and prediction of treatment response (825410)
Řešitel na MU: Mgr. Eva Budinská, Ph.D. Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta Období řešení: 1/2019 — 6/2024Investor/Program: Evropská unie / Horizon 2020 -
Výzkum studentů se zaměřením na chemické látky v prostředí a v lidském těle a jejich působení; transformační mechanismy, vývoj nových molekul umožňujících detekovat a kontrolovat chování a transport vybraných látek, vývoj signálních molekul a senzorů (MUNI/A/1091/2022)
Řešitel na MU: Mgr. Peter Šebej, Ph.D. Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta Období řešení: 1/2023 — 12/2023Investor/Program: Masarykova univerzita / Specifický výzkum - podpora studentských projektů -
CETOCOEN Plus (CZ.02.1.01/0.0/0.0/15_003/0000469)
Řešitel na MU: prof. RNDr. Jana Klánová, Ph.D. Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta Období řešení: 11/2015 — 6/2023Investor/Program: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR / OP Výzkum, vývoj a vzdělávání (OP VVV)
Další informace
Vedené práce
Obor: Bio-omika
Témata závěrečných prací (konzultant)
- The non-coding and coding RNA networks in the biology of B-cell leukemias and lymphomas – absolvent 2021
Obor: Environmentální chemie a toxikologie
Témata závěrečných prací (školitel)
- Mikrobiom u pacientů s kolorektálním karcinomem a u zdravých osob – probíhající studium
Výuka
Vyučované předměty
Akademický rok 2022–2023
Jaro 2023 na Lékařské fakultě
Podzim 2022 na Lékařské fakultě
Jaro 2023 na Přírodovědecké fakultě
- Analýza genomických a proteomických dat
- Analýza necílených dat z MS
- Bakalářská práce z matematické biologie a biomedicíny II
- Bakalářská státní závěrečná zkouška z Matematické biologie a biomedicíny
- Diplomová práce II
- Diplomová práce III
- Diplomová práce IV
- Týmový projekt z Matematické biologie a biomedicíny – biomedicínská bioinformatika
- Úvod do matematické biologie a biomedicíny II
Podzim 2022 na Přírodovědecké fakultě
- Analysis of sequencing data
- Analýza dat v R
- Analýza sekvencí DNA
- Bakalářská práce z matematické biologie a biomedicíny I
- Bakalářská práce z matematické biologie a biomedicíny II
- Detekce biomarkerů z omics experimentů
- Diplomová práce I
- Diplomová práce II
- Diplomová práce III
- Experimentální onkologie
- Projekt z Matematické biologie a biomedicíny - biomedicínská bioinformatika
- Úvod do matematické biologie a biomedicíny I
- Vícerozměrné metody - cvičení