Dr. Eva Budinská
Bioinformatika pro studium exposomu
Dr. Eva Budinská je vedoucí skupiny Bioinformatika pro exposomiku. Je bioinformatička a biostatistička s hlavním zaměřením na analýzu multimodálnych dát z omicsových experimentů (NGS, hmotnosní spektrometrie, mikročipy...). Její výzkum se zaměřuje zejména na vývoj metod a SW pro analýzu a integraci omicsových dat (genomika, transkriptomika, proteomika, metabolomika metagenomika, ...) a jejich aplikaci na detekci biomarkerů a generování hypotéz zejména v onkologii a exposomovýc studiích (např. Analýza metabolomových a mikrobiomových profilů dětí a matek ze studie CELSPAC, nebo analýza multimodálních profilů kolorektálního karcinomu).
Celkem publikovala 72 vědeckých článků s více než 1970 citacemi (h-index 19), aktuální informace lze najít na webu ResearcherID.
Dr. Budinská se účastní několika Evropských projektů (FP7 a H2020) a dvou národních prijektů (AZV a GAČR) jako PI.
Je vedoucí bakalářských, magisterských a doktorských prací a učí čtyři předměty: Analýza dat v R, Analýza sekvenačních dat, Analýza genomických a protoemických dat, Detekce biomarkerů z omicsových experimentů.
Vedoucí pracoviště
Docenti
Odborní asistenti
Odborní pracovníci
Externí pracovníci
Dlouhodobě mimo výkon práce
Publikace
-
Microbiome and Metabolome Profiles Associated With Different Types of Short Bowel Syndrome: Implications for Treatment
Journal of Parenteral and Enteral Nutrition, rok: 2020, ročník: 44, vydání: 1, DOI
-
Administration of the Probiotic Escherichia coli Strain A0 34/86 Resulted in a Stable Colonization of the Human Intestine During the First Year of Life
Probiotics and Antimicrobial Proteins, rok: 2019, DOI
-
Analysis of gene expression in CD26+ CML leukemic stem cell population.
Rok: 2019, druh: Konferenční abstrakty
-
Anti-alpha gal antibodies in the context of blood group and stool and tumour-adjacent microbiome in colorectal cancer patients
Rok: 2019, druh: Konferenční abstrakty
-
Breast Cancer Classification Based on Proteotypes Obtained by SWATH Mass Spectrometry
Cell Reports, rok: 2019, ročník: 28, vydání: 3, DOI
Projekty
-
Gut OncoMicrobiome Signatures (GOMS) associated with cancer incidence, prognosis and prediction of treatment response (825410)
Řešitel na MU: Mgr. Eva Budinská, Ph.D. Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta Období řešení: 1/2019 — 12/2023Investor/Program: Evropská unie / Horizon 2020 -
CETOCOEN Plus (CZ.02.1.01/0.0/0.0/15_003/0000469)
Řešitel na MU: prof. RNDr. Jana Klánová, Ph.D. Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta Období řešení: 11/2015 — 10/2022Investor/Program: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR / OP Výzkum, vývoj a vzdělávání (OP VVV) -
Molecular portraits of major morphological components of colon tumors (GA19-08646S)
Řešitel na MU: doc. Ing. Vlad Popovici, PhD Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta Období řešení: 1/2019 — 12/2021Investor/Program: Grantová agentura ČR / Standardní projekty -
Výzkum studentů zaměřený na chování chemických látek v prostředí a v lidském těle, transformačních mechanismů a změn které způsobují, vývoj nových molekul umožňujících kontrolovat chování a transport vybraných látek, vývoj senzorů a signálních molekul (MUNI/A/1499/2019)
Řešitel na MU: Mgr. Peter Šebej, Ph.D. Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta Období řešení: 1/2020 — 12/2020Investor/Program: Masarykova univerzita / Grantová agentura MU -
MErCuRIC - A Phase Ib/II study of MEK1/2 inhibitor PD--0325901 with cMET inhibitor PF--02341066 in KRASMT and KRASWT (with aberrant c--MET) Colorectal Cancer Patients (602901)
Řešitel na MU: doc. Ing. Vlad Popovici, PhD Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta Období řešení: 12/2013 — 11/2020Investor/Program: Evropská unie / 7. rámcový program EU